Zakład Badań nad Muzyką Dawną

Kierownik - dr hab. Jakub Kubieniec, prof. UJ

Pracownicy: dr Marek Bebak, prof. dr hab. Zofia Fabiańska, dr Maciej Jochymczyk, dr hab. Jakub Kubieniec, prof. UJ, dr hab. Aleksandra Patalas, prof. UJ, dr hab. Piotr Wilk, prof. UJ

Zakład Badań nad Muzyką od XIX do XXI wieku

Kierownik – prof. dr hab. Magdalena Dziadek

Pracownicy: dr hab. Rafał Ciesielski, prof. UJ, prof. dr hab. Magdalena Dziadek, dr Gabriela Gacek, dr Dagmara Łopatowska-Romsvik, dr Andrzej Sitarz

Pracownia Badań nad Multimedialnością Muzyki

Kierownik - dr Wojciech Marchwica, prof. UJ

Pracownicy: dr Wojciech Marchwica, prof. UJ, dr hab. Anna G. Piotrowska, prof. UJ

Pracownia Badań nad Zabytkami Muzycznymi

Kierownik – prof. dr hab. Renata Suchowiejko

Pracownicy: dr Sylwia Jakubczyk-Ślęczka, prof. dr hab. Renata Suchowiejko

Ośrodek Dokumentacji Muzyki Polskiej XIX i XX wieku im. I.J. Paderewskiego

Kierownik – dr Justyna Kica

Pracownicy: dr Michał Jaczyński, dr Justyna Kica

Biblioteka i Fonoteka IM UJ

Kierownik – kustosz dypl. mgr Stanisław Hrabia

Pracownicy: kustosz dypl. mgr Stanisław Hrabia, mgr Ewa Kołacka, mgr Michał Momot, mgr Anna Salamon